2023年10月26日上午,yl23411永利集团官网学术论坛邀请中国医学科学院基础医学研究所陈阳研究员带来了题为“染色质空间结构与功能的数字化建模技术研究”的精彩报告,报告在教一楼201进行,报告会由李静教授主持。

报告会上,陈阳研究员首先通过“一套基因组如何编码37万亿个细胞的功能?”的问题引入,讲解了染色质是基因组信息释放、加工的基础,介绍了从基因组到染色质结构与功能的重要研究计划,解释了染色质空间结构与基因表达调控的关系。
陈阳研究员介绍了其实验室相关研究方向:染色质结构与功能的数字化建模与人工调控。其中主要分为三个方向,组学观测、智能计算、人工调控。其中重点介绍了由Hi-C(High-Throughput Detection of Chromosomal Interactions)技术改进开发的技术:BL-Hi-C——染色质构象捕获技术,一种有效而灵敏的捕获染色质结构和调节相互作用的方法。此外还介绍了根据数学、生物信息学、机械学习等多领域结合,并由此开发的多种技术,如HiCDB、SDOC、FIND、3CPE、Hi-MS等技术,体现了多领域交叉的重要性。
陈阳研究员从实际出发,通过T细胞白血病的临床试验例子进行讲解。从基因组空间结构与基因表达差异、正常和疾病间存在基因组空间结构明显差异、基因组空间结构在肿瘤亚型间的差异、遗传变异介导的基因组空间结构改变、表观遗传改变介导的基因组空间结构改变、等多个方面说明了基因组调控机理研究为血液病分子诊断标志物开发提供了分子基础,在临床治疗中决定治疗方法提供有效可靠的帮助。

陈阳研究员讲解了在单细胞代谢组技术基础上,开展单组织细胞代谢-表观组技术研究方法,介绍了相关背景,说明了组织时空信息在生物医学中的重要性。介绍了空间代谢组学技术成像原理,空间代谢组学的技术特点等,讲解了SEAM(Spatial single nuclear metabolomics)方法的背景、流程、原理等,并举例了该方法在小鼠肝细胞中和人纤维化肝组织中的应用。
最后,陈阳研究院鼓励同学们积极进行跨学科交流,在热烈的掌声中结束了本次精彩的学术报告。
报告结束后,在场师生踊跃提问交流,陈阳研究员逐一耐心解答,为我院参会师生带来了一场精彩的学术报告。
报告人简介:
陈阳研究员,中国医学科学院基础医学研究所博士生导师,从事基因组学与生物信息学研究。其研究小组通过分子生物学、基因组学和计算机科学等多学科交叉,开发了业界广泛使用的染色质构象捕获技术BL-Hi-C;建立了一系列基因组空间结构与功能解析方法;发现了转录因子调控染色质结构的新规律;开发了国际上首个组织空间单细胞核代谢组技术SEAM。发表相关论文60余篇,代表性论文发表在Nature Methods(2021)、Nature Communications(2022,2017)、Genome Biology(2022,2015)、Genome Research(2018)等期刊。获得专利4项,软著2项。成果获2022年中华医学科技奖二等奖,入选2018年度、2021年度中国生物信息学十大进展。